Theo báo cáo của Bộ NN&PTNT, quy hoạch hệ thống khu bảo tồn biển Việt Nam đến năm 2020, đã được Thủ tướng Chính phủ phê duyệt từ năm 2010, nước ta sẽ có 16 khu bảo tồn biển. Tới thời điểm này, đã thành lập và hình thành được mạng lưới 9/16 khu, gồm: Bạch Long Vĩ, Cát Bà (Hải Phòng), Cù Lao Chàm (Quảng Nam), Cồn Cỏ (Quảng Trị), vịnh Nha Trang (Khánh Hòa), Núi Chúa (Ninh Thuận), Hòn Cau (Bình Thuận), Phú Quốc (Kiên Giang), Côn Đảo (Bà Rịa - Vũng Tàu).

Bộ NN&PTNT đánh giá, hiện hệ thống cơ chế, chính sách cho bảo tồn biển về cơ bản đã hình thành tương đối đồng bộ như: Luật Thủy sản, Luật Bảo vệ và phát triển rừng, Luật Đa dạng sinh học, Chiến lược quản lý hệ thống rừng đặc dụng, khu bảo tồn biển, khu bảo tồn vùng nước nội địa Việt Nam đến năm 2020 tầm nhìn 2030, Quy hoạch hệ thống khu bảo tồn biển Việt Nam…

Tuy nhiên, một số quy định tại các văn bản lại có sự khác biệt nên gây lúng túng trong quá trình triển khai; Bên cạnh đó, các khu bảo tồn biển thường gắn với những khu vực cộng đồng ngư dân nghèo, sống chủ yếu phụ thuộc vào nguồn lợi tự nhiên khai thác từ các khu bảo tồn, trong khi chính sách hỗ trợ tạo sinh kế cho họ chưa có, gây khó khăn cho công tác bảo tồn; Hơn nữa, công tác bảo tồn tại một số địa phương chưa thực sự được quan tâm đúng mức mà chủ yếu tập trung ưu tiên cho phát triển kinh tế.

Theo Thứ trưởng Bộ NN&PTNT Vũ Văn Tám, thời gian tới, cần nghiên cứu, xây dựng cơ chế chính sách khuyến khích sự tham gia của cộng đồng trong hoạt động bảo tồn biển, hỗ trợ chuyển đổi sinh kế cho cộng đồng ngư dân, đặc biệt là ngư dân sống chủ yếu dựa vào khai thác nguồn lợi tự nhiên từ các khu bảo tồn biển. Đồng thời tiếp tục đẩy mạnh triển khai quy hoạch chi tiết các khu bảo tồn biển thuộc danh mục đã được Thủ tướng Chính phủ phê duyệt; mở rộng và tăng cường hợp tác với các tổ chức, quốc gia có nhiều kinh nghiệm trong công tác bảo tồn biển để tìm kiếm sự giúp đỡ về kỹ thuật và tài chính cho công tác bảo tồn.